Может, это и не совсем корректно, но наверное, стоит всё же добавить HardwareSettings в строку Categories файла paprefs.desktop. А то уж очень сиротливо там выглядит одинокий Settings без дополнительных категорий. И в GNOME Control Center он из-за этого попадает в "Прочие", хотя остальная настройка звука обоснованно живёт в "Оборудовании".
paprefs-0.9.8-alt1.1 -> sisyphus: * Sun Aug 09 2009 Ilya Mashkin <oddity@altlinux> 0.9.8-alt1.1 - fix .desktop file (Closes: #20896)