Иконка появляется одновременно при установке программы сразу трёх разделах K-Menu - в "Система" и дважды в "Служебные" и здесь же в "Работа с файлами".
Ага, поскольку в наличии оба файла для меню: /usr/lib/menu/filelight /usr/share/applications/kde/filelight.desktop fixed in 1.0-alt6, спасибо.