При dist-upgrade file /usr/bin/xxd from install of xxd-7.2.148-alt2 conflicts with file from package vim-common-7.2-alt0.M41.2 E: Error while running transaction Удалил vim-common (с ним ушло vim-console) и dist-upgrade прошел нормально.
Пакет xxd был выделен из vim-common. Видимо вы делаете какой-то неправильный dist-upgrade.
Возможно, всё-таки стоит воткнуть в xxd Conflicts: на vim-common версий, содержавших этот файл, чтоб у апта был шанс учесть при обсчёте порядка обновления... А в текущих пакетах конфликта действительно нет (сизиф/5.0): Sisyphus/files/x86_64/RPMS> rpm -qlvp vim*| grep /usr/bin/xxd$ Sisyphus/files/x86_64/RPMS> rpm -qlvp xxd-7.2.166-alt1.x86_64.rpm| grep /usr/bin/xxd$ -rwxr-xr-x 1 root root 14584 May 3 23:41 /usr/bin/xxd 5.0/branch/files/x86_64/RPMS> rpm -qlvp vim*| grep /usr/bin/xxd$ 5.0/branch/files/x86_64/RPMS> rpm -qlvp xxd-7.2.148-alt2.x86_64.rpm| grep /usr/bin/xxd$ -rwxr-xr-x 1 root root 14584 Apr 14 00:42 /usr/bin/xxd