Честно говоря, не смотрел, где выставляются другие XDG-переменные, но те переменные в любом случае к среде не привязаны. А эта привязана (см. http://standards.freedesktop.org/menu-spec/latest/ar01s02.html). В этой связи просьба добавить в скрипт startgnome2 следующую строку: export XDG_MENU_PREFIX="gnome-" Её добавление специальной версии gnome-menus не требует, меню останутся в порядке.
gnome-session-2.26.2-alt2 -> sisyphus: * Thu Jul 23 2009 Yuri N. Sedunov <aris@altlinux> 2.26.2-alt2 - set XDG_MENU_PREFIX variable to "gnome-" in startgnome2 (closes #20852)