В случае корневого раздела на LVM инициализация происходит в mkinitrd, но при переходе на загрузку с диска содержимое /dev теряется и доступ к устройствам по символическим путям невозможен. Решением может быть вызов vgscan --mknodes в скрипте /etc/rc.d/scripts/lvm_start.
Может быть, уже есть готовый патч?
* Срд Сен 30 2009 Dmitry V. Levin <ldv@altlinux.org> 0.9.8.26-alt1 - scripts/lvm_start: Pass --mknodes to vgscan (Eugene Ostapets; closes: ALT#21492) закрываю давно исправленный баг.