При апгрейде конфликтует с mkvmerge-gui. Думаю, нужно выставить еще Obsoletes <= версии. P.S. А заодно и обновить :D
Почему обновить: mkvmerge, MKVToolNix GUI: bug fix: fixed the container type not being recognized properly by the GUI. Now the numerical container type ID is output in verbose identification mode by mkvmerge
DONE