В пакете xfce-polkit в /etc/xdg/autostart/xfce-polkit.desktop указано, чтобы он не запускался только в Gnome и KDE: NotShowIn=GNOME;KDE; Думаю, что стоит поменять на: OnlyShowIn=xfce; чтобы запускалось только для xfce. Как правило в большинстве DE есть свой polkit-агент.
xfce-polkit-0.3-alt2.g820497b -> sisyphus: Tue Sep 27 2022 Mikhail Efremov <sem@altlinux> 0.3-alt2.g820497b - Add Vcs tag. - Don't use rpm-build-licenses. - Upstream git snapshot (closes: #42060).