Необходимо добавить пакету phosh зависимости на gnome-shell-data и mutter-gnome, так как без них phosh не может запуститься.
phosh-0.29.0-alt1.1 -> sisyphus: Thu Jul 13 2023 Yuri N. Sedunov <aris@altlinux> 0.29.0-alt1.1 - required gnome-shell-data & mutter-gnome (ALT#46896)