Скрипт /usr/share/install2/preinstall.d/08-crypttab.sh не прописывает раздел swap в /etc/crypttab. В результате раздел swap не расшифровывается в процессе загрузки ни в initrd, ни в загруженной системе. Также, если корень не зашифрован, а зашифрован только swap, то фича luks не добавляется в /etc/initrd.mk
installer-1.15.7-alt1 -> sisyphus: Mon Jun 10 2024 Anton Midyukov <antohami@altlinux> 1.15.7-alt1 - preinstall.d/08-crypttab.sh: add lsblk for get MAJ:MIN of devices (Closes: 50589) - preinstall.d/08-crypttab.sh: add luks feature to initrd, if swap on luks