Сейчас ntop-3.3-alt2
Что-нибудь изменилось?
Если нет, хорошо бы, чтобы вы нашли в чём проблема ;)

у меня ntop-3.2-alt0.2.1 из бранча.
плагины  - двоятся (загружаются по два раза - сначала один комплект и следом второй)
Apr  1 15:25:28 samara ntop[10507]:   Loading plugin
'/usr/lib64/ntop/plugins/librrdPlugin.so'
Apr  1 15:25:28 samara ntop[10507]:   RRD: Welcome to Round-Robin Databases. (C)
2002-04 by Luca Deri.
Apr  1 15:25:28 samara ntop[10507]:   Loading plugin
'/usr/lib64/ntop/plugins/librrdPlugin-3.2.so'
Apr  1 15:25:28 samara ntop[10507]:   RRD: Welcome to Round-Robin Databases. (C)
2002-04 by Luca Deri.

и от этого постоянно в логе 
*WARNING** RRD:
rrd_update(/var/lib/ntop/ntop/rrd/interfaces/int/ethernetBytes.rrd) error:
illegal attempt to update using time 1207045553 when last update time is
1207045553 (minimum one second step)

как изначально конфигурировать загрузку плагинов - не нашел.
можно выключить вручную после загрузки в веб-интерфейсе (там все по два), но это
нифига неудобно.

может, кто знает, где он держит список плагинов, которые загрузит при старте?

ага! через веб видно два плагина rrd и две кнопки "включить" (на странице all
plugins). нажатие на одну из кнопок меняет статус сразу в ОБОИХ строках.

может быть потому что в /usr/lib64/ntop/plugins
все плагины лежат сами по себе + симв. ссылка?

-rw-r--r-- 1 root root 82712 Dec 29  2006 librrdPlugin-3.2.so
lrwxrwxrwx 1 root root    19 Apr  1 10:37 librrdPlugin.so -> librrdPlugin-3.2.so

удалил симв. ссылку. теперь плагин грузится 1 раз и ошибок про attempt to update
не выдает.
т.е. в первый проход сейчас грузится все кроме RRD (по названиям без версии?)
во второй проход грузится все то же + RRD (остальные найденные).
видимо, ссылки были как workaround, который устарел.

Вообще-то это давно исправлено в ntop-3.3-alt1

Точнее ntop-3.3-alt2