Никаких КДЕ и прочих Гном (чистый старый AfterStep), никаких 
subfs, только HAL+ivman запущенный от пользователя, апплет wmvolman чтоб 
вручную не набирать pumount.

Вставил CD, он опознался, примонтировался в /mnt/dvd. Вытащил диск,
[alexei@threebears ~]$ lsof | grep dvd
[alexei@threebears ~]$

т.е. никто на нем не открыл ничего. В логи валом валит вот это:
VFS: busy inodes on changed media.
VFS: busy inodes on changed media.
VFS: busy inodes on changed media.
VFS: busy inodes on changed media.
VFS: busy inodes on changed media.
VFS: busy inodes on changed media.

Лечится с помощью
pumount /mnt/dvd

  причем ТОЛЬКО от рута, от юзера получаю
[alexei@threebears ~]$ pumount /mnt/dvd
umount: only root can unmount /dev/hdc from /mnt/dvd

Аналогичное поведение и для USB-флэшек.