В данном случае виноват etcnet:

Причина становится ясна, если запустить ifdown && ifup вручную:
ctrl_iface exists and seems to be in use - cannot override it
Delete '/var/run/wpa_supplicant/ath0' manually if it is not used anymore
Failed to initialize control interface '/var/run/wpa_supplicant'.
You may have another wpa_supplicant process already running or the file was
left by an unclean termination of wpa_supplicant in which case you will need
to manually remove this file before starting wpa_supplicant again.

Проще говоря при опускании интерфейса etcnet не дожидается подыхания
суппликанта, и соотв. при следующем старте не может его поднять обратно ;)

Ясно. Вот примерный патч для решения этой проблемы. inotifywait из пакета
inotify-tool - c этим патчем ifdown && ifup для wireless устройств отрабатывает
корректно. Пакет inotify-tools очень маленький, ничего страшного не желает кроме
glibc. в общем - его можно смело тянуть в базовую систему. lioka, что скажешь ?

diff --git a/etc/net/scripts/shutdown-eth b/etc/net/scripts/shutdown-eth
index 1613edc..b6862b3 100755
--- a/etc/net/scripts/shutdown-eth
+++ b/etc/net/scripts/shutdown-eth
@@ -2,5 +2,5 @@
 
 if [ -s "/var/run/wpa_supplicant-$NAME.pid" ]; then
        kill `cat /var/run/wpa_supplicant-$NAME.pid`
-       rm -f -- "/var/run/wpa_supplicant-$NAME.pid"
+       inotifywait -q -t 10 -e delete /var/run/wpa_supplicant-$NAME.pid
 fi

Стас, но даже исправления этой ошибки в etcnet не решает проблему -
wpa_supplicant.conf не должен очищаться ни при каких условиях.

С данным патчем alterator-net-wifi не очищает конфиг wpa_supplicant.conf, если
интерфейс перед входов в настройку сети был UP.

Конфиг очищается если интерфейс был down.

Погоняйте на пользователях junior - если понравится - так и оставлю.

Что погонять ?

etcnet или alterator-net-wifi ?

Есть продвижения в исправлении этой ошибки ?

Я обошёлся без inotifywait, исправление будет залито как версия 0.9.4. Спасибо
за предложения.

Денис, залей пожалуйста 0.9.4 ещё и для branch/4.0

2boyarsh: Антон, это исправление нужно в 4.0.2 Desktop, не я один нарвался.

*** Bug 12774 has been marked as a duplicate of this bug. ***

Денис, а когда можно будет увидеть этот пакет в Sisyphus ?

Прямо сейчас занимаюсь этим.

Wrote: /home/pilot/RPM/RPMS/noarch/etcnet-0.9.4-alt0.1.noarch.rpm

Если никто не против, я ещё и проверить его хочу.

0.9.4 отправлен в incoming/Sisyphus, рекомендую сначала обкатать там при возможности

Можно закрывать и собирать для Desktop?

Мой тест с использованием etcnet-0.9.4-alt1 к вытиранию wpa_supplicant.conf не
привёл. Если консилиум со мной согласен, то предлагаю закрывать в обычном порядке.

Значит, так тому и быть.