я так понимаю с 1.6.6 он уже включен в апстрим.

не FIXED.

$ rpm -qR lyx | grep spell
libaspell.so.15  
$ rpm -q lyx
lyx-1.6.7-alt1

http://www.lyx.org/trac/ticket/6226 судя по таки в 1.6.6 патч есть.
Но там именно поддержка enchant
И.. оно я правильно понимаю не исключает aspell а добавляет еще и enchant ?
Requires ?

Я не знаю. Но если Вы спросите, как, с моей точки зрения было бы идеально собирать пакет - я отвечу: добавить enchant и избавиться от aspell. Последний уходит в небытие, что правильно.

ping

возможно, сборка новой версии позволит закрыть этот баг.

Хорошо, что нашёлся новый мэйнтейнер, спасибо, Глеб!
Плохо, что эту багу не исправили.

lyx-2:2.2.3-alt1 -> sisyphus:

Fri May 26 2017 Gleb F-Malinovskiy <glebfm@altlinux.org> 2:2.2.3-alt1
- Updated to 2.2.3.
- Built with enchant and hunspell instead of aspell (ALT#22053).