с некоторого времени игнорируется ~/.i18n если заходить в шелл через ssh или sudo su -, или su -

Соответственно у рута локаль становится в ru_RU.UTF-8, что приводит к целой массе проблем (начиная от запуска сервисов под этой локалью).

Предлагаю сделать возможность игнорирования ~/.i18n настраиваемой, и по умолчанию отключить.