откат до irqbalance-0.55-alt3 ситуацию исправляет. Ядро 2.6.32-ovz-el-alt40.M60P.2

Надо заметить, что S5500BC - первая плата от Intel, из тех, что когда-либо попадали мне в руки, у которой прерывания от устройств, если ничего не предпринимать, обрабатываются только на CPU0. До этого было всегда хоть какое-то распределение по разным ядрам/процессорам.
При этом, с ядром 2.6.18 (пробовал ставить 5.1 и ядро оттуда) некоторое распределение прерываний по ядрам присутствует тоже (без irqbalance, само по себе).

Если посмотреть strace-ом, то видно, что irqbalance 0.55 в smp_affinity пишет маски, соответствующие одиночным процессорам:

open("/proc/irq/65/smp_affinity", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC, 0666) = 3
fstat(3, {st_mode=S_IFREG|0600, st_size=0, ...}) = 0
mmap(NULL, 4096, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f236de3e000
write(3, "00000002", 8)                 = 8
close(3)                                = 0
munmap(0x7f236de3e000, 4096)            = 0
open("/proc/irq/70/smp_affinity", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC, 0666) = 3
fstat(3, {st_mode=S_IFREG|0600, st_size=0, ...}) = 0
mmap(NULL, 4096, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f236de3e000
write(3, "00000001", 8)                 = 8
close(3)                                = 0
munmap(0x7f236de3e000, 4096)            = 0
open("/proc/irq/69/smp_affinity", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC, 0666) = 3
fstat(3, {st_mode=S_IFREG|0600, st_size=0, ...}) = 0
mmap(NULL, 4096, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f236de3e000
write(3, "00000004", 8)                 = 8
close(3)                                = 0

В случае irqbalance 0.56 пишется маска 00ffffff:

open("/proc/irq/65/smp_affinity", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC, 0666) = 3
fstat(3, {st_mode=S_IFREG|0600, st_size=0, ...}) = 0
mmap(NULL, 4096, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f85b1474000
write(3, "00ffffff", 8)                 = 8
close(3)                                = 0
munmap(0x7f85b1474000, 4096)            = 0
open("/proc/irq/70/smp_affinity", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC, 0666) = 3
fstat(3, {st_mode=S_IFREG|0600, st_size=0, ...}) = 0
mmap(NULL, 4096, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f85b1474000
write(3, "00ffffff", 8)                 = 8
close(3)                                = 0
munmap(0x7f85b1474000, 4096)            = 0
open("/proc/irq/69/smp_affinity", O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC, 0666) = 3
fstat(3, {st_mode=S_IFREG|0600, st_size=0, ...}) = 0
mmap(NULL, 4096, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f85b1474000
write(3, "00ffffff", 8)                 = 8
close(3)                                = 0