Поддержка systemd добавлена

Вы проверяли? 
В всех unit-файлах стоит Type=oneshot, что не правильно, т.к. systemd, будет ожидать прекращения работы сервиса, как факт его правильной работы.

В вашем же случае, вы останавливаете загрузку системы.
Поправьте, пожалуйста.

unit-файлы взяты из Fedore с минимальными правками.

Проверил вручную, что zabbix_agentd, что zabbix_pgsql при запуске демонизируются самостоятельно, стопора загрузки быть не должно.

(В ответ на комментарий №3)
> unit-файлы взяты из Fedore с минимальными правками.
> 
> Проверил вручную, что zabbix_agentd, что zabbix_pgsql при запуске
> демонизируются самостоятельно, стопора загрузки быть не должно.

Имена unit-файлов, должны иметь такое же имя, как у rc-скриптов запуска сервиса, иначе systemd сочтёт их за два разных сервиса, как сейчас:

# systemctl status zabbix_agentd.service
zabbix_agentd.service - LSB: the zabbix network monitor agent
          Loaded: loaded (/etc/rc.d/init.d/zabbix_agentd)
...

И 
# systemctl status zabbix-agent.service
zabbix-agent.service - ZABBIX Monitor Agent
          Loaded: loaded (/lib/systemd/system/zabbix-agent.service; disabled)

для systemd - это два разных сервиса.

2.0.3-alt3

Created attachment 5657 [details]
tmpfiles.d conf

Created attachment 5658 [details]
патч на юнит

У меня работает с данными файлами и настройками юнита. Сервис корректно запускается и останавливается.

(В ответ на комментарий №6)
> Created an attachment (id=5657) [details]
> tmpfiles.d conf

Погодите, в пакете zabbix-common (на который по зависимостям ставится вместе со всеми другими zabbix-подпакетами) уже есть /etc/tmpfiles.d/zabbix.conf с содержимым:

D /var/run/zabbix 0755 zabbix zabbix -

разве его не достаточно?

исправления в unit файлы внесены

(В ответ на комментарий №9)
> (В ответ на комментарий №6)
> > Created an attachment (id=5657) [details] [details]
> > tmpfiles.d conf
> 
> Погодите, в пакете zabbix-common (на который по зависимостям ставится вместе со
> всеми другими zabbix-подпакетами) уже есть /etc/tmpfiles.d/zabbix.conf с
> содержимым:
> 
> D /var/run/zabbix 0755 zabbix zabbix -
> 
> разве его не достаточно?
> 

Достаточно, просто zabbix-common не обновился, при обновлении zabbix-agent и я не заметил данного изменения.
Только, переложите файл из /etc в /lib, т.к. это полиси.

думаю надо бы добавить в agent. зависимость на определённую версию common, в котором есть конфиг для tmpfiles.d

(В ответ на комментарий №11)
> думаю надо бы добавить в agent. зависимость на определённую версию common, в
> котором есть конфиг для tmpfiles.d

  На мой взгляд -- не строгую, вида:

Requires: zabbix-common >= V1.V2.V3-altR

где V1.V2.V3-altR версия и релиз пакета , начиная с которого присутствует конфиг для tmpfiles.d.

Посмотрите, пожалуйста 2.0.4-alt2