SUID он устанавливает на свой враппер, остальные файлы он не трогает. Запуск
из-под root всё-равно нужен для создания файла глобальных настроек в /etc, так
почему бы не нажать на кнопку, которая позволяет активировать режим non-root?
Процедура активации режима non-root служит для защиты от эксплоитов. 

А нельзя все это сделать из коробки, что бы пользователь не вникал ?

Можно. Достаточно переписать пол-программы. Я на такой подвиг не способен,
однако если есть желающие, то я не против.
Я отключил проверку прав в новой сборке (alt3), но считаю это в корне неверным,
так как, ещё раз повторюсь, если root по любому должен выполнять первый запуск
программы (пользователя в группу cdwriter добавляет тоже root, не так ли?), то
почему он не может одновременно активировать non-root режим. Тем более, что это
предлагается ему сделать сразу же при первом же запуске. Если раньше root мог
решать, кому с какой машины можно использовать xcdroot (не cdrecord!), а кому
можно писать только в консоли, то теперь эта фича бесполезна, а без root прогу
всё-равно не завести.