посмотрел, в федоре strongswan собирают так, что он не светит
свои команды наружу
# --with-ipsecdir moves internal commands to /usr/libexec/strongswan
# --bindir moves 'pki' command to /usr/libexec/strongswan
# See: http://wiki.strongswan.org/issues/552

конфликт, таким образом, исчезнет.

см. детали сборки в
http://mirror.yandex.ru/fedora/linux/development/rawhide/Everything/source/tree/Packages/s/strongswan-5.5.0-2.fc26.src.rpm

2 viy: спасибо!

Вообще с радостью отдам пакет опытному текущему пользователю, уже не применяю.

Я тоже не применяю, но конфликт мне не даёт собрать нужный дистрибутив.

Да. Надо сделать, как в Fedora
%configure --bindir=%{_libexecdir}/strongswan 
https://src.fedoraproject.org/rpms/strongswan/blob/master/f/strongswan.spec

strongswan-5.8.4-alt4 -> sisyphus:

 Thu Jul 16 2020 Sergey V Turchin <zerg@altlinux> 5.8.4-alt4
 - fix conflict with pki-tools (Closes: 32705)
 - package strongswan-starter unit