Проверил, c Альт Сервер 8 то же самое. Без возможности переподключения зависшие сессии будут накапливаться, пока не забьют память.

Есть у меня старенький 32-bit сервер, только для тестов и пригодный. На нём alt-p8-mate из starterkits, ещё до новогодних праздников ставил, значит из прошлогодней сборки. 
[root@testbox ~]# rpm -qa | grep nx
freenx-server-0.7.4-alt32
nx-3.5.1-alt13
Так вот, на нём сессия на suspending не подвисает и восстановление сессии по кнопке "Вернутся" - работает.
$ rpm -qa | grep opennx
opennx-0.16.e-alt30
Не работает на нынешних starterkits, Рабочей станции 8 и Сервере 8, независимо от разрядности. Я все перепробовал.

Проблема воспроизводится тока на systemd?

(В ответ на комментарий №3)
> Проблема воспроизводится тока на systemd?

Не знаю как попробовать без systemd. Для Mate требуется systemd, я не ошибаюсь? Можно бы попробовать с чем-нибудь кроме Mate, тогда прошу подсказки как пробовать.
С другой стороны, вот ведь сервер с прошлогодним mate-starter
$ ls -l /sbin/init
lrwxrwxrwx 1 root root 22 июн 12  2016 /sbin/init -> ../lib/systemd/systemd
вполне себе Mate и systemd и нет проблемы.

Однако. Если перед установкой freenx-server обновиться из p8 до актуального (apt-get dist-upgrade и перезагрузиться) то вроде проблемы нет. Отключенная сессия успешно переходит в состояние suspended и к ней, соответственно, можно переподключиться.
Получается что имеем плавающую проблему, которая при пересборке образа дистрибутива может исчезнуть, а затем снова всплыть. Лучше бы разобраться, пока известно как воспроизвести.

Что-то я думаю, что это показалось, и проблема никак не связана с системой и пакетами в ней.