[root@titan ~]# apt-cache showpkg 'libqwt.so.6()(64bit)'
Package: libqwt.so.6()(64bit)
[.. кусь ..]
Reverse Provides:
libqwt6-qt5 6.1.3-alt1
libqwt6 6.1.3-alt1

Получается, два разных пакета предоставляют библиотеку с одним и тем же soname. Более того, так как эти библиотеки слинкованы с разными версиями Qt, они не совместимы между собой, в том смысле что не взаимозаменяемы. Так быть не должно: если библиотеки не взаимозаменяемы, у них должен быть разный soname.

Эта проблема уже проявляется у пользователей, например:
* https://bugzilla.altlinux.org/35131
* https://bugzilla.altlinux.org/35834

Пожалуйтса, поменяйте soname у одной из библиотек. Предлагаю менять у libqwt6-qt5, так как у неё сейчас, как я понимаю, пока нет клиентов в Сизифе.