Подтверждаю. Та же фигня с pytables. Требует libnumpy-devel, как ни крути.

Предлагаю переделать libnumpy-devel и libnumpy-py3-devel следующим образом:

Перенести заголовки libnumpy-devel в директорию /usr/include/python2.7/numpy
Перенести заголовки libnumpy-py3-devel в директорию /usr/include/python3.8/numpy/
Причём, соответствующие цифры в именах директорий будут зависеть от текущих версий питона.

При этом в стандартных директориях для include файлов больше не будет директории numpy, и соответственно для сборки с numpy для python2 или python3 потребуется явно указывать дополнительные директории для поиска этих файлов. В .pc файлах также всё для этого присутствует.

Таким образом, больше не будет необходимости переделывать пути с "numpy/$something.h" на "numpy-py3/$something.h", в том числе у сгенерированных файлов, и всегда при сборке будут находится только заголовки для указанной версии numpy.

Если бы не ошибка 34619, можно было бы и вообще оставить заголовки в их директории по-умолчанию, в поддиректории %python_sitelibdir или %python3_sitelibdir.

Сделал тестовое задание #247694. Пока что с ним успешно пересобрались boost и blender. Попробую ещё другие пакеты. Планирую через несколько дней отправить это задание в Сизиф.

python-module-numpy-1:1.15.4-alt5 -> sisyphus:

 Wed Mar 11 2020 Aleksei Nikiforov <darktemplar@altlinux> 1:1.15.4-alt5
 - Moved include directories (Closes: #38013).

А что-нибудь мешает 1.15.4-alt5 и в p9 собрать?

(Ответ для Sergey Y. Afonin на комментарий #4)
> А что-нибудь мешает 1.15.4-alt5 и в p9 собрать?
250765 AWAITING #1 p9 python-module-numpy.git=1.15.4-alt5

(Ответ для Sergey Y. Afonin на комментарий #4)
> А что-нибудь мешает 1.15.4-alt5 и в p9 собрать?

Мешает.
Задание ломает пересборку следующих пакетов:

btrack-1.0.0-alt1.hg20140708
ffc-1.6.0-alt1.dev.git20150430.1
gdal-2.2.3-alt3.1
h5py-2.9.0-alt1
pybind11-2.2.4-alt1
python-module-Scientific-2.9.3-alt2
python-module-arrayfns-24.2-alt7
python-module-bottleneck-1.2.1-alt1
python-module-cyrand-0.3-alt1.git20150228.1.1.1
python-module-geo-1.0.0-alt1.svn20080909.5
python-module-gnuplot-1.8-alt4.1
python-module-gts-0.3.1-alt2.svn20090606
python-module-jsonpickle-0.9.5-alt1.1
python-module-lmoments3-0.3.1-alt1.git20140925.1
python-module-matplotlib-2.2.3-alt3
python-module-mdp-3.4-alt2.git20140427
python-module-nifti-0.20090303.2-alt3.git20090924
python-module-pyamg-2.2.1-alt2
python-module-pyannote.core-0.3.4-alt1.git20150304.1.1
python-module-pycdf-0.6_0-alt7
python-module-pygsl-2.2.0-alt1
python-module-pyhacrf-0.1.2-alt1.1.1
python-module-pylbfgs-0.2.0.12-alt1
python-module-pysparse-1.3-alt1.git20130305
python-module-scikits.bootstrap-1.0.0-alt1.1
python-module-scikits.vectorplot-0.2-alt2.git20150130.1.1.1
python-module-seqlearn-0.2-alt2.1
python-module-shapely-1.5.17-alt1.post1.1.1.1
python3-module-scikit-image-0.15.0-alt1
python3-module-wavelets-1.0.2-alt2
uhd-3.14.1.1-alt1.1

Удаляю задание.

(In reply to Andrey Cherepanov from comment #6)

> > А что-нибудь мешает 1.15.4-alt5 и в p9 собрать?
> 
> Мешает.
> Задание ломает пересборку следующих пакетов:

Да, что-то много.

> uhd-3.14.1.1-alt1.1

Как раз вот его хотелось обновить для обновления gpsd. А если все ломающиеся пакеты тоже обновить?

(Ответ для Sergey Y. Afonin на комментарий #7)
> (In reply to Andrey Cherepanov from comment #6)
> 
> > > А что-нибудь мешает 1.15.4-alt5 и в p9 собрать?
> > 
> > Мешает.
> > Задание ломает пересборку следующих пакетов:
> 
> Да, что-то много.
> 
> > uhd-3.14.1.1-alt1.1
> 
> Как раз вот его хотелось обновить для обновления gpsd. А если все ломающиеся
> пакеты тоже обновить?

Обновляйте.

15 из них удалены из Sisyphus, в основном модули питона:

btrack-1.0.0-alt1.hg20140708
python-module-Scientific-2.9.3-alt2
python-module-cyrand-0.3-alt1.git20150228.1.1.1
python-module-gts-0.3.1-alt2.svn20090606
python-module-lmoments3-0.3.1-alt1.git20140925.1
python-module-mdp-3.4-alt2.git20140427
python-module-nifti-0.20090303.2-alt3.git20090924
python-module-pyamg-2.2.1-alt2
python-module-pyannote.core-0.3.4-alt1.git20150304.1.1
python-module-pycdf-0.6_0-alt7
python-module-pygsl-2.2.0-alt1
python-module-scikits.bootstrap-1.0.0-alt1.1
python-module-scikits.vectorplot-0.2-alt2.git20150130.1.1.1
python-module-seqlearn-0.2-alt2.1

Из них 4 есть в виде python3-*:

python3-module-mdp
python3-module-pyamg
python3-module-pyannote.core
python3-module-pygsl

Что-то пока не знаю, может правильнее uhd по старому собрать.

(In reply to Sergey Y. Afonin from comment #9)
> 15 из них удалены из Sisyphus, в основном модули питона:
> Из них 4 есть в виде python3-*:
> 
> python3-module-mdp
> python3-module-pyamg
> python3-module-pyannote.core
> python3-module-pygsl
> 
> Что-то пока не знаю, может правильнее uhd по старому собрать.
А может быть уже пора обсуждать план выкидывания ненужных модулей python2 из p9?