Скорее, это проблема того что не активировалась альтернатива. Посмотрю. 
Спасибо. 

Исправлено, проверьте плиз. 

У меня все по-прежнему:

$ rpm -ql python-base | grep etc
/etc/buildreqs/files/ignore.d/python
/etc/buildreqs/packages/substitute.d/python
/etc/emacs/site-start.d/python.el-2.3

python-base-2.3.4-alt3 (сборка от 17 ноября ??? )

Это ничего не доказывает. В этом пакете либо альтернатива,  
либо тригер создают симлинк /etc/emacs/site-start.d/python.el. 
 
Киньте вывод двух команд: 
 
ls -al /etc/emacs/site-start.d/ 
 
rpm -qa "python-*" 
 
ЗЫ: У меня с этой же версией такой симлинк есть.