Такие неконсистентности между зависимостями Python проекта и RPM пакета случаются. Лучше их избегать, но какого-то единого подхода нет.

Добавлено в kubernetes-client 34.1.0:
https://github.com/kubernetes-client/python/commit/b647e9a576702d9ac9cf09520b50363c0fffb9a3

Удалено (нет релиза):
https://github.com/kubernetes-client/python/commit/b01d03d7b34ee3e25e9a9d5a1226b68f626ab529

В данном случае установка зависимостей Python проекта с помощью pip внутри изолированного от пакетного индекса окружения выглядит излишней (может быть, для "--with-python-packages=system" это попытка проверить, что рантайм зависимости действительно установлены):
https://github.com/syslog-ng/syslog-ng/blob/develop/modules/python-modules/Makefile.am#L109-L117

Переключение "--with-python-packages" в "none" выключает установку с pip:
https://github.com/syslog-ng/syslog-ng/blob/develop/configure.ac#L584-L586

(Ответ для Stanislav Levin на комментарий #1)

> Переключение "--with-python-packages" в "none" выключает установку с pip:
> https://github.com/syslog-ng/syslog-ng/blob/develop/configure.ac#L584-L586

С none собирается, спасибо.

> Такие неконсистентности между зависимостями Python проекта и RPM
> пакета случаются. Лучше их избегать, но какого-то единого подхода нет.

Если пакет собирается без такой проверки, это на работоспособность, в итоге, повлияет же, если модули из репозитория использовать? Ограничения по версиям наверное не зря делают?

(In reply to Sergey Y. Afonin from comment #2)
> Если пакет собирается без такой проверки, это на работоспособность, в итоге,
> повлияет же, если модули из репозитория использовать? Ограничения по версиям
> наверное не зря делают?

Ограничения (в апстриме) делаются по очень разным причинам, среди которых может быть как и действительная несовместимость, так и искуственная. Например, один наиболее распространенных инструментов для обновления версий зависимостей - dependabot (https://docs.github.com/en/code-security/getting-started/dependabot-quickstart-guide#about-dependabot). То есть надо разбираться в каждом случае.

> Component: python3 → syslog-ng

Компонент, всё же Питон, а syslog-ng так, пострадавший. Вот надо ли фиксить - вопрос.