Воспроизводится на стендах, обновлённых до Sisyphus:
Alt Education 11.1 XFCE/KDE x86_64
Alt KWorkstation 11.4 x86_64
Alt Workstation 11.2 x86_64
Alt Server 11.1 x86_64

Версия пакета:
opencommit-3.3.9-alt1.noarch

Описание:
При вызове внутри рабочего репозитория команда 
$ oco hook set
выводит ошибку
Error: EPERM: operation not permitted, chmod '.git/hooks/prepare-commit-msg'

При этом ошибка не препятствует дальнейшей корректной работе пакета, при вызове git commit автоматически запускается opencommit и генерирует сообщение к коммиту.

Ошибка связана с тем, что пытается изменить права на файл .git/hooks/prepare-commit-msg, который является симлинком на файл /usr/lib/opencommit/cli.cjs, который в свою очередь принадлежит пользователю root.

Шаги для воспроизведения:
1) Создать и перейти в репозиторий
2) Выполнить команду
$ oco hook set

Ожидаемый результат:
Команда успешно выполняется.

Реальный результат:
Выводится ошибка Error: EPERM: operation not permitted, chmod '.git/hooks/prepare-commit-msg'. При этом функционал работает корректно.