обновлять иксы принято предворительно выйдя из них. специально для вас могу
сделать в %pre killall X

(In reply to comment #1) 
> обновлять иксы принято предворительно выйдя из них. специально для вас могу 
> сделать в %pre killall X 
 
Оказывается, локальные иксы хорошо переносят, плохо становится Иксам,  
запущенным на других машинах. Интересно, в чём отличие. 
 
Мне кажется, это "принято" давно не актуально. Я всегда обновляю систему, и 
Иксы, и KDE, при запущенном KDE. Иксы - такая же программа, как и все 
остальные, и требовать не использовать synaptic для dist-upgrade было бы 
неправильным. 
 
P.S. Делать killall X не надо :) 

И всё-таки (оставив в стороне "принято"). 
В чём концептуальная проблема сохранить связь Иксов с сервером шрифтов после 
обновления? 
Могу новую багу создать: о неиспользовании сервера шрифтов в десктопной 
системе. 

(In reply to comment #3)   
> В чём концептуальная проблема сохранить связь Иксов с сервером шрифтов после    
> обновления?    
   
в том что иксы теряют сокет xfs при перезапуске xfs. это можно объехать  
повесив xfs не на сокет а на tcp порт (но это несекьюрно)  
   
> Могу новую багу создать: о неиспользовании сервера шрифтов в десктопной    
> системе.    
   
в десктопной системе сервер шрифтов не нужен  

Так и я о том, что не нужен :)