подтверждаю.
повторяется при настроенном автовходе на #altlinux :) (больше никаких автовходов
нет).

Похоже, не входит и в том случае, когда не смогло после запуска сразу 
подключиться к 1-му серверу в списке и перешло ко 2-му.

точно... именно так.

В добавок к этому пропадает навсегда "marker line" (на русский не переведено) 
в этом канале. 
xchat-2.4.3-alt1 

(In reply to comment #4)
> В добавок к этому пропадает навсегда "marker line" (на русский не переведено) 
> в этом канале. 
А оно вообще часто пропадает (причем в вендовых официальных и не очень сборках 
тоже). Жми Ctrl-M.

На 2.6.1 автовход работает.
Правда, там при реконнекте какой-то гадкий диалог, но тем не менее.

2.6.1-alt1

xchat-2.6.6-alt1
Снова поломалось. При обыкновенном сплите вроде работает, не работает в таком 
случае:

--- Closing Link: henker[~henker@....ru] (Ping timeout)
--- Соединение разорвано (Remote host closed socket).
--- Ищу сервер irc.mv.ru..
...
--- *** You are connected to RusNet. Please wait...
--- #lrn :Nick/channel is temporarily unavailable

Далее происходит полный коннект на сервер, выскакивает motd, но на канал не 
заходит сам.

Это значит, что канал в сплите, и на него зайти не получится. Читайте RusNet 
FAQ,