Вешаю на pygobject, поскольку вероятно, в нестабильной ветви что-то накосячили. Meld не показывает содержимое текстовых буферов, жалуясь в консоли на что-то на тему toggle_unref при выполнении GtkTextBuffer.get_buffer() (сорри, что не указываю конкретно, при необходимости могу воспроизвести).
не моё...
Где-то по дороге pygobject стабилизировался, так что сейчас всё в порядке.