При включении Compiz панель задач при неактивности становится почти прозрачная и невидимая. Видимость наступает при движении мышью над панелью. Очевидно, нужно посмотреть или параметры прозрачности панели XFCE по умолчанию или сделать исключение полупрозрачности для класса панелей XFCE в параметрах настройки Compiz.
Fixed in 6.0.0rc1 LiveCD.