С оригинальным agpgart патчем от nvidia ati карты не работают. В ac4 патче от Алена Кокса эта проблема решена заменой строки agp_bridge.gatt_table[nvidia_private.pg_offset + j] = mem->memory[i]; на agp_bridge.gatt_table[nvidia_private.pg_offset + j] = agp_bridge.mask_memory(mem->memory[i], mem->type); в файле /usr/src/kernel/patches/kernel-fix-drivers-char/02_nvidia-agp-support.patch Дополнительно надо добавить Option \"AGPFastWrite\" \"off\" в секцию \"Device\" XF86Config-4 --- ---
Как я понял, это уже очень давно не актуально...