После обновления 05.02.2006 большого количества пакетов, связанное с изменением pkg-config при запуске GNOME metacity не может нормально стратовать. Из-за этого GNOME не работает. Я так и не нашёл, с чем это могло бы быть связано. P.S. Может это только у меня такой глюк.
Нужно сделать buildreq в libgnomeui, чтобы зацепились libICE-devel и libSM-devel. gnome-session пересобирать не обязательно, но не помешает.
Fixed in libgnomeui-2.12.0-alt1.2