В graphviz-dot-x11-preview.desktop надо добавить NoDisplay=true , иначе пункт меню видно, но при запуске тупо висит в фоне.
task #272530: added #100: build tag "2.41.2-alt5" from /people/mike/packages/graphviz.git
graphviz-2.41.2-alt5 -> sisyphus: Tue May 25 2021 Michael Shigorin <mike@altlinux> 2.41.2-alt5 - viewer: avoid hitting menu (ALT#40094); thx zerg@