В багах #34319 и #34505 описана суть, для обновления до Sisyph'a необходимо сначала обновить rpm и apt. После обновления  apt и rpm делаю dist-upgrade, он выдает ошибку:
...
1038 будет обновлено, 163 новых установлено, 7 пакетов будет заменено, 8
пакетов будет удалено и 5 не будет обновлено.
Необходимо получить 0B/954MB архивов.
После распаковки потребуется дополнительно 458MB дискового пространства.
Продолжить? [Y/n] 
Совершаем изменения...  
Подготовка...                                     
####################################################################################################
[100%]
        файл /usr/lib64/lua/5.1 из устанавливаемого пакета
liblua5.1-5.1.5-alt14.x86_64 конфликтует с файлом из пакета
lua5.1-alt-compat-1.0-alt1.x86_64
        файл /usr/share/lua/5.1 из устанавливаемого пакета
liblua5.1-5.1.5-alt14.x86_64 конфликтует с файлом из пакета
lua5.1-alt-compat-1.0-alt1.x86_64
E: Ошибка во время исполнения транзакции



Помогает при обновлении apt удалить конфликтующие пакеты:
# apt-get install apt rpm lua5.3 liblua5.1- lua5.1-alt-compat-
liblua5.1-preinstall- lua-module-luasocket