К сожалению, версии unison 2.9.1 и 2.9.20 несовместимы. Получилось, что мне
понадобилось синхронизировать файлы с debian, а в грядущем релизе debian sarge
планируется наличие именно 2.9.1 ( http://packages.debian.org/testing/net/unison
), потому что тамошний мантейнер не хочет ставить в релиз бета-версию...

http://rpmseek.com/rpm-pl/unison.html?hl=com&cs=unison:PN:0:0:0:0 показывает,
что другие дистрибутивы придерживаются версии 2.9.1, отмеченной на сайте
разработчиков как стабильная.

Для меня оптимальным вариантом видится наличие в Sisyphus переключающихся через
альтернативы unison 2.9.1 и свежайшего unison из ветки 2.10.x, в которой
поддерживается GTK2 UI.

P.S. Само собой, я не стану возражать, если альтернатив будет 3, включая
нынешнюю версию 2.9.20 :-) А пока просто пересобрал для себя 2.9.1 и поставил на
Hold в apt.