Если на диске есть windows-раздел и ему указать точку монтирования 
/mnt/windows, при подтверждении форматирования у него стоит галка. 
На мой взгляд, по умолчанию она должна быть снята. 
 
И еще сюда-же. 
Если до установки на диске уже были разделы, то раздел с точкой монтирования 
/home в списке подтверждения форматирования не появляется. Наверно его 
надо в список внести со снятой галкой, чтобы юзер уже решал, форматировать 
его или нет.