По простоте душевной скопировал как есть /usr/share/doc/hasher-1.0.34/apt.conf к себе в HOME и попробовал его как есть попользовать $ hsh --apt-conf=apt.conf ... долго не мог понять почему не работает, пока не осенило , что знак комментария в apt.conf должен быть в стиле С а не # Посему предлагаю в /usr/share/doc/hasher-1.0.34/apt.conf заменить # на //
Fixed in 1.0.34-alt1-g6579ab5.
В 1.0.35-alt1 исправлено.