Значки в программах, запущенных через Wine, не имеют цвета - например в 1С 7.7 Подробности здесь: http://bugs.etersoft.ru/show_bug.cgi?id=932
У меня воспроизводится на текущий nx и freenx из Сизифа. Клиент от nomachine. Тривиальный софт который так выглядит, winrar.
На нового маинтейнера
fixed