/boot форматирование по-умолчанию не очень правильно. У меня, например общий /boot с другим Linux и постоянно приходится уберать галочку на форматирование /boot
другим (большинству, как мне представляется) пришлось бы постоянно галочку ставить -- wontfix.
Тут вопрос в том, что если галочка не установленна, то ничего страшного, а вот если установлена, то удаляется ценная информация.
Ну так не делай общий /boot, чудак-человек :) Зачем он вообще тебе сдался? Отдельные /var и /usr понимаю, а этот костыль был в первую очередь полезен во времена проблемы 1024-го цилиндра. Это всякие редхаты до сих пор с деревьев не слезли, не обращай вминания.