В /etc/httpd2/conf/mods-available у .conf'ов нет "mod_" в названии. У данного же пакета - mod_rpaf.conf. Стоит переименовать (втч и в mods-enabled, если модуль включен при апгрейде).
Эх, наши любимые однобайтовые ошибки. Костик, давай сделаем, чтоб в Server 4.0.2 так не было? :)
исправил в mod_rpaf-0.6-alt2
