Мне кажется разумным следующее поведение: по команде rsync from foo/bar/to создавать foo, bar и to, а не только to при наличии foo и bar. (ср. mkdir и mkdir -p) Какой-то патч для этого у меня имеется, но корявый. Плюс, в безопасности подобного решения я не уверен.
rsync -R