Надо бы добавить или Conflicts:, или Provides:/Obsoletes: file /usr/include/GL/glut.h from install of libmesa-devel-7.0.3-alt5 conflicts with file from package freeglut-devel-2.4.0-alt1 E: Error while running transaction
упс... в libmesa-devel этого быть вообще не должно
7.0.3-alt7