в xdrawchem: Помощь -> Руководство Открывается /usr/share/xdrawchem/doc/index.html, которого естественно нет. Насколько я понимаю, надо открывать /usr/share/doc/xdrawchem-1.9.9/index.html
Спасибо, исправил в xdrawchem-1.9.9-alt1.src.rpm
1.9.9-alt1 - ok