rp-pppoe-server поддерживает работу в режиме ядра, обеспечивая более высокую производительность, для этого требуется наличие скомпиленного модуля pppoe в ядре и наличие поддержки этой фичи в userspace. Если эта фича не сильно привязана к версии текущего ядра, может ее стоит включить?
Плагин rp-pppoe.so сейчас собирается из самого пакета ppp. В чем отличие этого плагина от того, который может собираться из rp-pppoe я не разбирался, но с текущим, из ppp, работает. Так что собирать еще один смысла нет.