synce-sync-engine-0.12 является noarch. C 'BuildArch: noarch' прекрасно собирается и на x86_64. Работает как на x86, так и на x86_64.
исправлено. Вот только в новом libopensync я решил для плугинов использовать не %_libexecdir, а %_libdir. Как в этом случае сделать noarch питон-плугин ещё не знаю. Буду думать.