При появлении любых диалоговых окон (убитый Vim, изменившийся файл...) gVim перестаёт реагировать и на клавиатуру, и на мышь. Пакетная база специфическая - GNOME из /pub/people/gnome-2.25 поверх бранча 5.0, но есть подозрение, что такая же проблема может быть и в Сизифе.
7.2.130-alt1. gvim-neXtaw работает, gvim-gtk2 работает.
gvim-gnome2 тоже работает.
Видимо, это последствия непересборки Vim с libgtk+2 из people.
Это видимо проблема нового gtk. По хорошему vim должен либо выноситься, либо продолжать работать.