в rc,sysinit прописано два вызова сервиса clock
...
# Set the system clock (when /etc/adjtime is missing)
[ -s /etc/adjtime ] || /etc/init.d/clock start

и еще раз после # Remount the root filesystem read-write
# Set the system clock (when /etc/adjtime is present)
[ ! -s /etc/adjtime ] || /etc/init.d/clock start

проблема в том, что в openvz-контейнере, где этот сервис надо бы отключить
(no clock setting is required/allowed in container) 
его прописывание в rc.sysinit, а не как обычно в rcN.d, не дает возможности 
это сделать корректно.

если есть возможность перенести вызов из rc.sysinit в rcN.d, было бы неплохо (а то в логе регулярно hwclock: hwclock: Cannot access the Hardware Clock via any known method.