По видимому, информация о том, что по умолчанию bundle создаётся в $TMPDIR/default.bun ("The default output name is $TMPDIR/default.bun ($output)") - не соответствует действительности. По окончанию работы mkve-bundle в $TMPDIR от него остаётся только каталог hasher и файл mkve-bundle.log
Кстати, создаётся он в $HOME/default.bun
(В ответ на комментарий №1) > Кстати, создаётся он в $HOME/default.bun Не, в $(pwd)/default.bun http://git.altlinux.org/people/aspsk/packages/?p=mkve.git;a=commit;h=8de0a42e6a4c4831c57ea2c6ccaaf0fe8435f4d5