Довольно нелогично, что java-common требует jpackage-utils (ну это ладно), а последний требует rpm-build-java (вот это и вправду странно)
Если развешаете баги на пакеты из списка http://repocop.altlinux.org/pub/repocop/reports/txt/by-test/altlinux-java-not-buildrequires-rpm-build-java.txt то ускорите процесс :) осталось 4 пакета (не мои), которые блокируют. Их ругает repocop. http://repocop.altlinux.org/pub/repocop/reports/txt/by-test/altlinux-java-not-buildrequires-rpm-build-java.txt и добавите что этот баг depends на баги на те 4 пакета. *** This bug has been marked as a duplicate of bug 16571 ***