Если при одной транзакции apt-get install или apt-get dist-upgrade устанавливается (или удаляется) более одного пакета, требующих исполнения update-menus, то пользователь получает битое меню приложений в виндоуменеджере. Причина в том, что исполняется до конца только первый запуск update-menus а все последующие видя, что процесс уже запущен просто завершаются.
---

---
По предложению ldv, следует изменить работу update-menus в том случае, если при старте уже исполняется другая копия, запущенная раньше. Вместо того, что бы завершаться, процесс должен килять ранее запущенный экземпляр и исполняться вместо него. Таким образом будет получен каскад запусков update-menus на каждый пакет, требующий этого, но до конца доработает только тот экземпляр, который был запущен последним, остальные будут остановлены, что и требуется.