Если добавить в initrd.mk, скажем, PUT_FILES = /etc/issue получаем следующую разницу: Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: ash Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: cat Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: kill Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: ln Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: ls Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: mkdir Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: mknod Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: mktemp Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: mount Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: readlink Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: rm Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: sh Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: sleep Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/bin: umount Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/etc: group Только в /tmp/make-initrd.rkxT5fHAm/2.6.34-wrar-1.initrd/img/etc: issue Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/etc: passwd Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libacl.so.1 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libacl.so.1.1.0 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libattr.so.1 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libattr.so.1.1.0 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libblkid.so.1 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libblkid.so.1.1.0 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libcap.so.2 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libcap.so.2.16 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: librt-2.11.1.so Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: librt.so.1 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libuuid.so.1 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libuuid.so.1.3.0 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libz.so.1 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib: libz.so.1.2.3 Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: ata_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: cdrom_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: edd_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: firmware Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: path_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: scsi_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: usb_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/lib/udev: vol_id Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: blkid Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: halt Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: modprobe Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: poweroff Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: reboot Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: udevadm Только в /tmp/make-initrd.5K1Y7CGGX/2.6.34-wrar-1.initrd/img/sbin: udevd
Как вы понимаете PUT_FILES это переменная, содержащая файлы которые будут скопированы в образ. Вы можете полностью изменить этот список. Если же вы хотите добавить файлы, то вам нужно делать: PUT_FILES += /etc/issue