В скрипте есть явные ссылки на pam_ldap.conf и slapd.conf. Последний у нас устанавливается из openldap2.4-servers, который вытягивается по зависимости на /etc/rc.d/init.d/slapd. Может быть имеет смысл заменить её на openldap-servers? Ещё в /usr/bin/alterator-openldap-functions вызывается команда net. То есть, похоже, нужна ещё зависимость на samba-common. И, видимо, на pam_ldap, в котором у нас pam_ldap.conf.